Ns

値のあるヒートマップ(ggplot2)



Heatmap With Values



解決:

これは、tidyverseの原則に準拠し、ggplot2の不適切な使用を改善するように更新されました

SlowLeranerのコメントによると、私はこれを簡単に行うことができました。



library(tidyverse)##データデータを作成する<- matrix(rnorm(100, 3, 1), ncol=10) ## reshape data (tidy/tall form) dat2 % tbl_df() %>%rownames_to_column( 'Var1')%>%gather(Var2、value、-Var1)%>%mutate(Var1 = factor(Var1、levels = 1:10)、Var2 = factor(gsub( 'V'、 ''、 Var2)、levels = 1:10))##プロットデータggplot(dat2、aes(Var1、Var2))+ geom_tile(aes(fill = value))+ geom_text(aes(label = round(value、1))) + scale_fill_gradient(low = '白'、high = '赤')

ここに画像の説明を入力してください


値を使用してヒートマップを作成する別の簡単な方法があります。これを行うには、pheatmapを使用できます。



どれの<- matrix(rnorm(100, 3, 1), ncol=10) names(dat) <- paste('X', 1:10) install.packages('pheatmap') # if not installed already library(pheatmap) pheatmap(dat, display_numbers = T)  

これはあなたにこのようなプロットを与えるでしょう

値のあるヒートマップ

クラスタリングを削除して配色を使用したい場合は、次のことができます。



pheatmap(dat、display_numbers = T、color = colorRampPalette(c( 'white'、 'red'))(100)、cluster_rows = F、cluster_cols = F、fontsize_number = 15)

クラスタリングと赤白のないヒートマップ

表示される数字のフォントサイズ、形式、色を変更することもできます。